晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）以及远山和叶（宫村优子 配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量……
悠木碧 斋藤千和 水桥香织 喜多村英梨 加藤英美里 野中蓝 阿澄佳奈 后藤邑子 岩永哲哉 吉田圣子 新谷良子 岩男润子 松冈祯丞 赤崎千夏 五十岚裕美 上田丽奈 木岛隆一 河西健吾 阿座上洋平 前田邦宏
J·K·西蒙斯 詹森·舒瓦兹曼 拉什达·琼斯 琼·库萨克 诺曼·麦克唐纳徳 威尔·萨索 塞尔希奥·巴勃罗斯 米拉·布雷纳 内达·玛格丽特·拉巴 悉尼·布朗 泰迪·布鲁姆 艾玛·香农 肯德尔·卓依 朱利安·赞恩 阿曼达·菲莉普森 芬·卡尔 塔克·米克 海莉·赫尔米达 杰登·贝滕古
水田山葵 大原惠美 和多田美咲 种崎敦美 久野美咲 嘉数由美 木村昴 关智一 铃鹿央士 松本保典 三石琴乃 山路和弘 石井康嗣 伊达干生 藤本美贵 富泽岳史 天月 拜真之介 田岛章宽 井口祐一 久保田光 松井晓波 木村珠莉
柿原彻也 平野绫 钉宫理惠 中村悠一 大原沙耶香 佐藤聪美 堀江由衣 远藤绫 金井美香 辻亲八 小野凉子 羽多野涉 东地宏树 中原麻衣 喜多村英梨 安元洋贵 樱井浩美 伊濑茉莉也 小西克幸 诹访部顺一 川原庆久 新井里美 井口祐一 岸尾大辅 泽城美雪 白熊宽嗣 宫田幸季 森久保祥太郎 石井康嗣 生天目仁美 游佐浩二 大木民夫 挂川裕彦 冈田圭右 吉木梨纱 FROGMAN
正在加载